Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD3A6NKT7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms