Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CAPN6Q9Y6Q1 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAPN6Q9Y6Q1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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