Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SHOC2Q9UQ13 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms