Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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COPS7AQ9UBW8 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COPS7AQ9UBW8 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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