Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BBS9Q3SYG4 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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