Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CSPP1Q1MSJ5 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms