Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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RTN1Q16799 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTN1Q16799 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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