Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HIF1AQ16665 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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