Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms