Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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