Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms