Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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VPS72Q15906 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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