Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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