Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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