Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TTF1Q15361 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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TTF1Q15361 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TTF1Q15361 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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