Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC3Q15034 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms