Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMCO1Q147U7 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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