Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms