Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CACNA1SQ13698 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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