Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CUL4BQ13620 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms