Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
NEUROD1Q13562 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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