Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXE3Q13461 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms