Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MSLNQ13421 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
MSLNQ13421 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms