Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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PTGDRQ13258 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PTGDRQ13258 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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