Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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