Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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GPS1Q13098 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GPS1Q13098 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
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GPS1Q13098 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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GPS1Q13098 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GPS1Q13098 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GPS1Q13098 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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