Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRDP23468 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms