Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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PTPRAP18433 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRAP18433 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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