Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CCSO14618 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CCSO14618 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCSO14618 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCSO14618 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCSO14618 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CCSO14618 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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