Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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