Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTAQ92696 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGGTAQ92696 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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