Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ZBED9Q6R2W3 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZBED9Q6R2W3 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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