Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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PTPROQ16827 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPROQ16827 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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PTPROQ16827 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPROQ16827 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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