Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms