Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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VAMP3Q15836 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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VAMP3Q15836 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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VAMP3Q15836 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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VAMP3Q15836 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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