Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SKIV2LQ15477 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SKIV2LQ15477 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SKIV2LQ15477 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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SKIV2LQ15477 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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SKIV2LQ15477 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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