Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SSPNQ14714 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms