Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SCARB2Q14108 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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