Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CACNA1CQ13936 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CACNA1CQ13936 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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