Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PKP1Q13835 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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