Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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ITGA9Q13797 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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ITGA9Q13797 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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