Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
APOFQ13790 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
APOFQ13790 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
APOFQ13790 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
APOFQ13790 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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APOFQ13790 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
APOFQ13790 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
APOFQ13790 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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