| RUNX3 | Q13761 | AL593851.1-201 | ENST00000426171 | 157 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004160.1-205 | ENST00000428967 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365396.1-201 | ENST00000430854 | 671 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445490.2-201 | ENST00000440492 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445524.1-202 | ENST00000440665 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161937.1-201 | ENST00000444478 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007099.2-201 | ENST00000444852 | 336 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133217.1-201 | ENST00000450980 | 425 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01005-202 | ENST00000451440 | 531 nt | TSL 4 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX41-209 | ENST00000451478 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1orf185-202 | ENST00000467127 | 747 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049830.2-201 | ENST00000480072 | 201 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2A20P-203 | ENST00000498397 | 1268 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093725.2-201 | ENST00000507808 | 356 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OTUD4-208 | ENST00000509620 | 864 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC010587.2-201 | ENST00000511727 | 448 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC015468.3-201 | ENST00000518967 | 417 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC093012.1-203 | ENST00000548437 | 450 nt | TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC120349.2-201 | ENST00000625002 | 298 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM157B-203 | ENST00000639350 | 358 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HDX-202 | ENST00000373177 | 2924 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM71D-211 | ENST00000612183 | 1790 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC30A6-203 | ENST00000379343 | 2354 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEC31A-215 | ENST00000505472 | 4159 nt | TSL 5 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF542P-204 | ENST00000482727 | 1305 nt | BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPP2R5C-226 | ENST00000557095 | 1307 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DTHD1-202 | ENST00000456874 | 3365 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025164.2-202 | ENST00000499685 | 5699 nt | TSL 3 BASIC | 3.17 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLPPR4-201 | ENST00000370184 | 4505 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C5orf51-201 | ENST00000381647 | 5241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NTS-201 | ENST00000256010 | 1237 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR30E-201 | ENST00000362104 | 92 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C20orf187-201 | ENST00000378252 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1226P-201 | ENST00000384317 | 107 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2V1P2-201 | ENST00000397758 | 440 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CXADR-203 | ENST00000400165 | 603 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009518.2-201 | ENST00000418056 | 731 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND2P18-201 | ENST00000419962 | 1030 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096632.1-201 | ENST00000427395 | 310 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBXN7-204 | ENST00000428095 | 1173 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC119800.1-201 | ENST00000429871 | 423 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445567.1-201 | ENST00000439121 | 144 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL929236.1-201 | ENST00000443622 | 518 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6K5P-201 | ENST00000447050 | 945 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCB1-IT1-202 | ENST00000451443 | 251 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P2-201 | ENST00000457365 | 171 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004924.1-201 | ENST00000480160 | 781 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS4XP22-201 | ENST00000480755 | 780 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | NAA50-206 | ENST00000493454 | 964 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002460.1-201 | ENST00000504394 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAIP2-205 | ENST00000510080 | 858 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109445.1-201 | ENST00000512356 | 383 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106744.2-201 | ENST00000513955 | 898 nt | TSL 5 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107463.1-202 | ENST00000514526 | 689 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P30-201 | ENST00000515244 | 580 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB9P3-201 | ENST00000521269 | 501 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XIRP2-AS1-201 | ENST00000525330 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003461.1-201 | ENST00000528866 | 78 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC125611.1-201 | ENST00000549563 | 229 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008015.1-201 | ENST00000555505 | 465 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016597.1-201 | ENST00000564893 | 528 nt | TSL 4 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MMP2-AS1-201 | ENST00000565307 | 593 nt | TSL 4 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR5047-201 | ENST00000579212 | 100 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4K7P-201 | ENST00000580232 | 945 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01909-202 | ENST00000584919 | 815 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011461.1-201 | ENST00000592671 | 357 nt | TSL 3 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103881.1-201 | ENST00000603476 | 538 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031281.1-201 | ENST00000604049 | 488 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010680.4-201 | ENST00000605334 | 543 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC072039.2-201 | ENST00000608883 | 439 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001521.1-201 | ENST00000609150 | 300 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC121761.2-201 | ENST00000617300 | 689 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U7.8-201 | ENST00000619968 | 63 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007998.5-201 | ENST00000622938 | 237 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTG3-AS1-201 | ENST00000626994 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMARCA2-229 | ENST00000634781 | 1106 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6.98-201 | ENST00000637157 | 84 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103706.2-201 | ENST00000638080 | 240 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R30-201 | ENST00000539585 | 1687 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SGO1P2-201 | ENST00000429458 | 1589 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF736P9Y-201 | ENST00000439586 | 1345 nt | BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYNE1-207 | ENST00000367255 | 27748 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCEL-202 | ENST00000377246 | 3081 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEL1L2-202 | ENST00000378072 | 1892 nt | TSL 2 BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CRISP3-201 | ENST00000263045 | 2170 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XRCC4-203 | ENST00000396027 | 1530 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BIRC3-201 | ENST00000263464 | 5197 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |