Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms