Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HDAC1Q13547 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HDAC1Q13547 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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