Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3FQ13275 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SEMA3FQ13275 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms