Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIN2BQ13224 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIN2BQ13224 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms