Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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CBX3Q13185 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CBX3Q13185 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CBX3Q13185 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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