Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DUSP4Q13115 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DUSP4Q13115 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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