Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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CSTF3Q12996 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CSTF3Q12996 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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