Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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BNIP3Q12983 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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BNIP3Q12983 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BNIP3Q12983 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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